لا تزال هناك عدة عقبات تواجه ترجمة علاجات الخلايا الجذعية العضلية إلى العيادة. أولاً، لا يزال فهمنا للأسس الجزيئية الدقيقة التي تميز الخلايا الجذعية المتعددة الأطراف المختصة بالتجديد الذاتي بكفاءة من الأسلاف الذين لا يستطيعون تطعيم الألياف العضلية  غير كافٍ. نتوقع المزيد من العمل في هذا المجال لتحقيق اختراقات مهمة حول الآليات التي تتحكم في إمكانات التجدد لـ MuSCs.

 ثانياً، تم تحسين أنظمة الاستزراع في المقام الأول باستخدام MuSCs الماوس، وما إذا كان يمكن تطبيق هذه الأساليب نفسها على MuSCs البشرية يحتاج إلى تأكيد - خاصة وأن MuSCs البشرية والفئران لها خصائص وظيفية متميزة. ثالثًا، سيتطلب الانتقال نحو العيادة في النهاية كواشف متوافقة بشكل أفضل مع اللوائح، مثل الوسائط الخالية من المصل وأنظمة الاستزراع المحددة كيميائياً. إن استبدال المكونات مثل الأمصال الحيوانية ليس بالأمر البسيط ويمثل عقبة بيولوجية رئيسية أمام توليد خلايا من الدرجة السريرية في ظل ممارسات التصنيع الجيدة الحالية (cGMP).

أخيراً، تُظهر تجربة علاجات CAR-T المعتمدة مؤخراً بوضوح أن أساليب الطب الشخصي يمكن أن تكون باهظة الثمن بشكل لا يصدق بسبب التكاليف الثابتة المتأصلة لتوليد خلايا خاصة بالمريض. ينبغي النظر في المسائل المتعلقة بالقدرة على تحمل التكاليف والفعالية المتوقعة لاستراتيجيات العلاج بالخلايا على خلفية التطورات الحديثة المتنافسة في، على سبيل المثال، العلاجات الجينية بوساطة AAV وأساليب تصحيح الجينات القائمة على CRSPR لضمور العضلات، والتي أدت أيضًا إلى أظهروا وعدًا هائلاً في تصحيح العيوب الوراثية في نماذج الاعتلال العضلي قبل السريري ويدخلون العيادة