عند زراعتها كتجمعات في المعلق، تشكل الخلايا الجذعية الجنينية مجمعات ثلاثية الأبعاد ومتعددة الخلايا تسمى الأجسام الجنينية. تشبه هذه الهياكل الكروية أسطوانات البيض للأجنة بعد 6 إلى 8 أيام من الإخصاب.

عند زراعتها كتجمعات في المعلق، تشكل الخلايا الجذعية الجنينية مجمعات ثلاثية الأبعاد ومتعددة الخلايا تسمى الأجسام الجنينية. تشبه هذه الهياكل الكروية أسطوانات البيض للأجنة بعد 6 إلى 8 أيام من الإخصاب. بعد حوالي 4 إلى 8 أيام، تحتوي هذه الأجسام الجنينية عادةً على هياكل عظمية بين الخلايا المتوسطة الداخلية والخلايا الظهارية الخارجية والتي تبدأ في الانقباض تلقائياً. تعبر هذه الهياكل العظمية عن البروتينات القلبية الرئيسية وتظهر خصائص الانقباض وإمكانات الفعل والاستجابات الكرونوتروبية المشابهة لتلك الموصوفة للأجسام الجنينية. تشبه الخلايا الجذعية الجنينية المبكرة المشتقة من الخلايا الجذعية الجنينية التي تتشكل في الخلايا الظهارية خلايا جهاز تنظيم ضربات القلب والخلايا العضلية القلبية الأولية. في وقت لاحق، تتطور الخلايا الأذينية والبطينية والعقدية وخلايا الهيستامين وخلايا بوركينجي.  يتم التعبير عن عوامل النسخ القلبية Nkx2.5 وGATA-4 وMEF2C مبكرًا أثناء التمايز، بينما تعبر الخلايا الجذعية الأكثر نضجاً عن عامل الأذين المدر للصوديوم (ANF) ومبادل الصوديوم والكالسيوم والفوسفولامبان بالإضافة إلى البروتينات البنيوية مثل سلسلة الميوسين الخفيفة (MLC)-2v وسلسلة الميوسين الثقيلة α وβ والتيتين (نطاق Z وM) وα-actinin وتروبونين القلب T وα-actin وبروتين M